Forskning styrker betydelsen av att studera sällsynta, återkommande somatiska mutationer i ER + bröstcancer

The Third Industrial Revolution: A Radical New Sharing Economy (Juli 2019).

Anonim

Nyliga forskning och genomiska studier har avslöjat ett antal gener som ackumulerar somatisk eller ej ärftlig, mutationer och förändringar i östrogenreceptorpositiv (ER +) bröstcancer. Men medan några förändringar är ganska vanliga och relativt väl förstådda, muteras flera gener i mindre än 5 procent av fallen totalt sett. Som ett resultat har lite varit känt om hur ovanliga mutationer påverkar sjukdomsutfallet. För att ta itu med detta problem genomförde forskare från Baylor College of Medicine i samarbete med Washington University i St. Louis och University of British Columbia den hittills största analysen, som involverade mer än 2 500 ER + bröstcancerfall, för att upprätta föreningar mellan sällsynta somatiska mutationer och prognoser. Studien publiceras i Nature Communications .

"I ER + bröstcancer påverkar huratiska genmutationer de långsiktiga effekterna av tamoxifenbehandling dåligt, " säger Dr. Meenakshi Anurag, instruktör och cancerinformatikutredare i Lester och Sue Breast Center i Baylor. "För att studera somatiska mutationer och förstå deras inverkan på prognosen, sekvenserade vi 83 gener i totalt 953 primära ER + bröstcancerprover."

För att undersöka både unga och äldre patienter var 625 prov från postmenopausala kvinnor och 328 premenopausala kvinnor diagnostiserade över två decennier sedan, vilket gav möjlighet att undersöka sambandet mellan cancermutation och den långsiktiga risken för återfall. DNA-hybridfångst, sekvensering av 83 gener och noggrann bioinformatikanalys användes för att kompensera för åldersgränsen för proven och bristen på matchat normalt DNA, vilket normalt krävs för studier av detta slag.

"Vi kunde därefter validera våra resultat i en självständigt publicerad kohort som heter METABRIC, som omfattar cirka 1 400 ER + bröstcancerpatienter, med inriktning på gener som överlappade mellan de två studierna, säger Anurag.

Forskargruppen rapporterar konsekventa föreningar med resultat för två relativt vanliga mutationer i två tumörsuppressorgener som kallas MAP3K1 och TP53-genen, som hade motsatta effekter. MAP3K1 är förknippad med gynnsamma resultat, och TP53 med dålig prognos. Dessa resultat förväntades från tidigare studier. Tidigt återfall och dödsfall befanns emellertid vara associerade med ovanliga mutationer i tre gener, DDR1, en kollagenreceptor, PIK3R1, en signalundertryckare och NF1, en negativ regulator för RAS-onkogenen.

"Lågfrekventa mutationer, som DDR1 och NF1, måste uppmärksammas, för även om dessa mutationer anses vara sällsynta, förknippas de med tidigt återfall och död, vilket gör dem mycket vanligare hos patienter som tyvärr dör av sjukdomen och Därför kan de vara kritiska terapeutiska mål. Deras identifikation ger oss också mycket viktiga molekylära ledtrådar i arten av aggressivt tumörbeteende ", säger Dr. Matthew Ellis, McNair Scholar och direktör för Lester och Sue Smith Breast Center, en del av NCI -designad Dan L Duncan Omfattande Cancer Center vid Baylor.

"När vi inte botar någon sjukdom, beror det på att vi inte har gjort den rätta diagnosen på grundmolekylär nivå. ER + bröstcancer har en mängd olika resultat och molekylära egenskaper, och därmed finns det helt enkelt inte en" one size fit allt "behandlingslösning. Slutligen beror framsteg på en grundläggande förståelse för vad som driver cancer i varje enskilt fall, och tumör-DNA-sekvensering kommer att ingå i det diagnostiska pusset", tillade Ellis, som också är precisionschefen medicin i Dan L Duncans omfattande cancercentrum vid Baylor.

Utforska vidare: Nya ledtrådar gjuter för att förstå återfall i bröstcancer